Česká republika dlouhodobě podporuje Pákistán prostřednictvím projektů rozvojové spolupráce v celé řadě oblastí, jako je školství, zdravotnictví, rovnoprávnost žen, rozvoj venkova a mnohé další. Každoročně místním organizacím nabízí možnost spolupráce v řadě rozvojových oblastí, a společně s nimi pak implementuje projekty ve vybraných oblastech země.

V minulosti již ČR rovněž několikrát nabídla Pákistánu humanitární pomoc.

Velkým úspěchem je zejména fungování České nemocnice v Arandu/Gilgit/Baltistán, kterou Česká republika prostřednictvím Velvyslanectví ČR v Islámábádu aktivně podporuje již několik let.