Decentralizovaná spolupráce mezi regiony obou zemí se rozvíjí od vzniku regionálního uspořádání České republiky, tedy od roku 2000. V současné době existuje pět velmi aktivně se rozvíjejících dohod o institucionalizované spolupráci mezi francouzskými a českými kraji:

• Středočeský kraj a kraj (région) Bourgogne-Franche-Comté – smlouva podepsána v roce 2001 s bývalým krajem Bourgogne,
• Moravskoslezský kraj a kraj (région) Grand-Est – smlouva podepsána v roce 2001 s bývalým krajem Lorraine,
• Pardubický kraj a kraj (région) Centre-Val-de-Loire – smlouva podepsána v roce 2003 s bývalým krajem Centre,
• Kraj Vysočina a kraj (région) Grand-Est – smlouva podepsána v roce 2006 s bývalým krajem Champagne-Ardenne,
• Plzeňský kraj a kraj (région) Bourgogne-Franche-Comté – smlouva podepsána v roce 2007 s bývalým krajem Franche-Comté, spolupráce ukončena v létě 2018.             
• Jihomoravský kraj a okres (département) Gers – smlouva podepsána v roce 2007.

Existuje rovněž mnoho spoluprací mezi českými a francouzskými městy a obcemi: seznam

Podrobnosti o spolupráci měst bývají na internetových stránkách jednotlivých radnic, např. Tábor-Dole  nebo Slavkov u Brna-Darney.

Dotazy nebo informace ohledně bilaterální spolupráce můžete zasílat na obchodně-ekonomické oddělení velvyslanectví České republiky v Paříži commerce_paris@mzv.cz.